expr:class='"loading" + data:blog.mobileClass'>


Search in navarinoinvestment

auto slider

Δευτέρα, 22 Ιουνίου 2020

Scientists produce first open source all-atom models of COVID-19 'spike' protein

The virus SARS coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the known cause of coronavirus disease 2019 (COVID-19). The "spike" or S protein facilitates viral entry into host cells.

Now a group of researchers from Seoul National University in South Korea, University of Cambridge in UK, and Lehigh University in USA, have worked together to produce the first open-source all-atom models of a full-length S protein. The researchers say this is of particular importance because the S protein plays a central role in viral entry into cells, making it a main target for vaccine and antiviral drug development.

The details can be found in a paper , "Developing a Fully-glycosylated Full-length SARS-CoV-2 Spike Protein Model in a Viral Membrane" just published online in The Journal of Physical Chemistry B.

This video demo illustrates how to build this membrane system from their SARS-CoV-2 S protein models. The model-building program is open access and can be found from the home page of CHARMM-GUI by clicking on the COVID-19 Archive link , or by clicking the archive link in the header, then the COVID-19 Proteins link in the left sidebar.

Developed by Wonpil Im , a professor in Lehigh University's Department of Biological Sciences and Bioengineering Department, CHARMM-GUI (GUI = graphical user interface) is a program that simulates complex biomolecular systems simply, precisely and quickly. Im describes it as a "computational microscope" that enables scientists to understand molecular-level interactions that cannot be observed any other way. More information about CHARMM-GUI can be found in this video .

"Our models are the first fully-glycosylated full-length SARS-CoV-2 spike (S) protein models that are available to other scientists," says Im. "I was fortunate to collaborate with Dr. Chaok Seok from Seoul National University in Korea and Dr. Tristan Croll from University of Cambridge in the U.K. Our team spent days and nights to build these models very carefully from the known cryo-EM structure portions. Modeling was very challenging because there were many regions where simple modeling failed to provide high-quality models."

Scientists can use the models to conduct innovative and novel simulation research for the prevention and treatment of COVID-19, according to Im.

The S protein structure was determined with cryo-EM with the RBD up (PDB ID: 6VSB), and with the RBD down (PDB ID: 6VXX). But, this model has many missing residues. So, they first modeled the missing amino acid residues, and then other missing domains. In addition, they modeled all potential glycans (or carbohydrates) attached to the S protein. These glycans prevent antibody recognition, which makes it difficult to develop a vaccine. They also built a viral membrane system of an S protein for molecular dynamics simulation.


Δευτέρα, 8 Ιουνίου 2020

Δημήτριος Κάκκαβος-Ο Φιλιατρινός Μακεδονομάχος

ΔΗΜΗΤΡΙΟΣ ΚΑΚΚΑΒΟΣ του Νικολάου (1870–1960)

Επιφανής στρατιωτικός και πολιτικός. Βουλευτής Θεσσαλονίκης και αντιπρόεδρος της βουλής. 
Ο «Ζώης» του Μακεδονικού Αγώνα. 
Ο Δημήτριος Κάκκαβος του Νικολάου
ήταν Έλληνας στρατιωτικός και μετά την αποστρατεία του  πολιτευτής. Υπηρέτησε ως βουλευτής Θεσσαλονίκης και ως αντιπρόεδρος της  Βουλής.

Σάββατο, 6 Ιουνίου 2020


-«Αν δεν προσκυνήσετε τον μεγάλο βασιλιά θα σας θανατώσουμε».
-«Θανατώστε μας, άλλωστε για αυτό ήρθαμε, αλλά δεν προσκυνάμε!».
Όταν, στην πρώτη εκστρατεία των Περσών, ο Δαρείος έστειλε κήρυκες στην Σπάρτη, όπως έκανε και σε όλες τις πόλεις της Ελλάδος, για να ζητήσουν «γην και ύδωρ», οι Λακεδαιμόνιοι τους πέταξαν σε ένα πηγάδι και τους καλούσαν να πάρουν από κει «γην και ύδωρ» και να τα παν στον βασιλιά τους..

Επίσκεψη Αρχηγού ΓΕΣ στην Περιοχή Ευθύνης της 1ης ΣΤΡΑΤΙΑΣ

Επίσκεψη Αρχηγού ΓΕΣ στην Περιοχή Ευθύνης

Το διήμερο 3 και 4 Iουνίου 2020, ο Αρχηγός του Γενικού Επιτελείου Στρατού, Αντιστράτηγος Χαράλαμπος Λαλούσης, πραγματοποίησε επίσκεψη στην Περιοχή Ευθύνης της 1ης ΣΤΡΑΤΙΑΣ/EU-OHQ/«ΑΧΙΛΛΕΑΣ», συνοδευόμενος από τον Διοικητή της, Αντιστράτηγο Βασίλειο Παπαδόπουλο.
Συγκεκριμένα, την Τετάρτη 3 Ιουνίου 2020, ο Αρχηγός αρχικά επισκέφθηκε τη Σχολή Μονίμων Υπαξιωματικών (ΣΜΥ) στα Τρίκαλα όπου ενημερώθηκε για τη λειτουργία της Σχολής, περιηγήθηκε στους χώρους αυτής, παρακολούθησε εκπαιδευτικές δραστηριότητες και απηύθηνε σύντομο χαιρετισμό στους Σπουδαστές της. Στη συνέχεια επισκέφθηκε το 303 Προκεχωρημένο Εργοστάσιο Βάσης (ΠΕΒ) στη Λάρισα, όπου ενημερώθηκε για το έργο του και παρακολούθησε επίδειξη εκθεμάτων κατασκευών και καινοτόμων εφαρμογών που εξελίσσει το εργοστάσιο.

Τετάρτη, 3 Ιουνίου 2020

Οι Δεσμώτες του Φαλήρου

Δεκάδες σκελετοί σιδηροδέσμιοι, σε μακριά συστοιχία ο ένας δίπλα στον άλλον αποκαλυφτηκαν κατά την δημιουργία του Κέντρου πολιτισμού του Ιδρύματος «Σταύρος Νιάρχος» 
.Πομπή καταδικασμένων σε θάνατο; 
Ενας αλλόκοτος χορός εγκληματιών, εχθρών του λαού της αρχαϊκής Αθήνας που συνδέονται με το Κυλώνειο Aγος; Ποιοι είναι αυτοί που δέχτηκαν τη χαριστική βολή και βυθίστηκαν στο χώμα, πιθανότατα καταντροπιασμένοι και άκλαυτοι, καταραμένοι από την οργή του όχλου;